由于制药行业产生的废水经过处理后氯离子含量超标，不能直接排放，需降低水中的氯离子指标后方可达标排放。

废水是制药企业的主要污染排放物。制药废水成分复杂主要包括抗生素生产废水、合成药物生产废水、中成药生产废水以及各类制剂生产过程的洗涤水和冲洗废水四大类。

制药当中产生分废水成分复杂主要包括抗生素生产废水、合成药物生产废水、中成药生产废水以及各类制剂生产过程的洗涤水和冲洗废水四大类。成分复杂、有机物含量高、毒性大，属难处理的工业废水。随着我国医药工业的发展，制药废水已逐渐成为重要的污染源之一，如何处理该类废水是当今环境保护的一个难题。

在早期的一些医药化工有机污水处理工程中,直接利用稀释水把进水中的有毒物质浓度稀释到微生物生长容许浓度,然后进行生化处理。这是一种最为简单的方法,易于操作和管理。但稀释法存在的缺点是非常明显的,增加处理规模和基建投资,增加原污水的运行费用,同时浪费大量的宝贵水资源。